SoSe2021
Folienübersicht
R Markdown
Von R zum finalen Bericht
Wie kann man aus R heraus Ergebnisse in verschiedensten Ausgabeformaten präsentieren?
Quelle: rmarkdown.rstudio.com
Von R zum finalen Bericht mithilfe von R Markdown
- ist eine vereinfachte Auszeichnungssprache, mit der sich Web-Inhalte, Berichte oder Präsentationen leicht erstellen lassen.
- kann die Ausgabe Deines R Codes, wie z.B. Abbildungen und Tabellen, mit Text zu einem Bericht verweben.
- unterstützt verschiedene statische wie auch dynamische Ausgabeformate.
- koppelt verschiedene Prozesse in einer einzigen ‘render’ Funktion:
Basierend auf dem R Markdown cheat sheet (unter CC-BY-SA Lizenz)
Eine kurze Einführung
Quelle: rmarkdown.rstudio.com
Wie wird eine .Rmd-Datei erstellt?
Wie wird eine .Rmd-Datei erstellt?
Wahl des Ausgabeformat
Struktur einer .Rmd Datei
Übersetzung in das Ausgabeformat
(Markdown) Syntax
Quelle: rmarkdown.rstudio.com
HTML vs. Markdown vs. R Markdown Syntax
Quelle: Donovan, T., Brown, M., & Katz, J. (2015). Vermont Cooperative Fish and Wildlife Research Unit R Projects: R for Fledglings, https://www.uvm.edu/rsenr/vtcfwru/R/fledglings/08_Markdown.html
(unter CC-BY-NC-ND 4.0 Lizenz)
(unter CC-BY-NC-ND 4.0 Lizenz)
Weitere Infos
- Das cheatsheet gibt Dir einen guten Überblick.
- R Studio bietet auch ein nützliches Nachschlagewerk.
- Als Einstieg ist auch die R Markdown Website von R Studio hilfreich.
- Um tiefer einzutauchen lohnt sich ein Blick in das umfangreiche Onlinebuch R Markdown: The Definitive Guide von den Entwicklern des rmarkdown Pakets.
Das cheatsheet ist frei zugänglich auf: https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/
Übungsaufgabe
Aufgabe
Erstellung eines R Markdown Dokuments
Überführe Deine Fallstudie aus DS1 in eine R Markdown Datei, welches als Output-Format ein PDF erstellt:
Fragen?
Bei weiteren Fragen: saskia.otto(at)uni-hamburg.de
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License except for the borrowed and mentioned with proper source: statements.
Image on title and end slide: Section of an infrared satellite image showing the Larsen C ice shelf on the Antarctic Peninsula - USGS/NASA Landsat: A Crack of Light in the Polar Dark, Landsat 8 - TIRS, June 17, 2017 (under CC0 license)